Rupi on yksi vanhimmista perunoiden bakteeritaudeista. Se on tunnettu yli 100 vuotta ja rajoittaa edelleen perunan tuotantoa maailmanlaajuisesti johdonmukaisen valvonnan puutteen vuoksi. Rupi ei vaikuta satoon, mutta ihon korkkiset vauriot, sekä pinnalliset että kuoppaiset, heikentävät sadon laatua ja myyntikelpoisuutta.
Tavallinen rupi on maaperän Streptomyces-bakteerin aiheuttama. Useimmat Streptomyces-lajit eivät ole patogeenisiä, mutta muutamalla on patogeenejä. Streptomyces scabies (syn. Streptomyces scabiei) on patogeeninen laji, jota on tutkittu laajemmin kuin muita tavallisia rupilajeja. Se on grampositiivinen, rihmamainen bakteeri, joka tuottaa sekä myseeliä että itiöitä. Se voi selviytyä loputtomiin maaperässä saprofyyttina tai muilla isännillä, kuten punajuurilla, nauriilla, porkkanoilla, palsternakkilla, retiisillä ja rutabagasilla. Optimaalinen maaperän pH-alue Streptomycesille on 5.5–7.5.
S. syyhy tunkeutuu nuoriin mukuloihin linssien, stomatien tai mustelmien kautta. Mukuloiden alkaessa muodostuvat pienet mukulat ovat herkimmässä vaiheessa. Vauriot laajenevat perunoiden kypsyessä, ja kypsillä perunoilla on paksumpi kuori kuin pienillä mukuloilla ja ne kestävät infektioita. Maaperän kosteuden pitäminen pellon kapasiteetissa tai sen lähellä XNUMX–XNUMX viikon ajan mukuloiden muodostumisesta alkaen vähentää tavallisen ruven esiintymistä. Ainoa luotettava rupien torjuntamenetelmä on vastustuskykyisten lajikkeiden käyttö. Valitettavasti määrä vastustuskykyisiä lajikkeita on rajoitettu.
Miksi rupien hallinta on ollut mahdotonta niin monta vuotta? Tämän ongelman aiheuttajat ovat:
- Uusien patogeenisten Streptomyces spp:n nopea kehitys luo geneettistä monimuotoisuutta. Patogeeninen S. scabies tuottaa toksiinia, Thaxtomin A:ta, joka estää selluloosan tuotantoa kasvavien perunoiden tartunnan saaneissa kudoksissa. Tämä selluloosan puute johtaa vaurioihin. Thaxtomin A:n synteesistä vastaava geeni löytyy patogeeniselta saarelta, osa DNA:ta, joka kantaa myös tartunnan ja virulenssin edellyttämiä geenejä. Patogeeniset saaret voidaan siirtää konjugoimalla S. scabiesista ei-patogeenisiin Streptomyces spp. Tämä selittää uusien patogeenisten lajien jatkuvan ilmaantumisen. Geneettinen monimuotoisuus vaikeuttaa rupille vastustuskykyisten lajikkeiden kasvattamista.
Yhteys yleisen rupien esiintyvyyden ja vakavuuden ja maaperän kemiallisen koostumuksen välillä on monimutkainen ja kullekin maaperälle ominaista. Erot maaperän koostumuksessa, maaperän rakenteessa, pH:ssa, orgaanisessa aineessa, mikrobifloorassa, kosteudessa vaikuttavat rupien esiintyvyyteen ja vakavuusasteeseen. Tästä syystä johtamiskäytännöt, jotka vähentävät yleistä rupia yhdellä alalla, eivät toimi muilla aloilla.
Maaperän käsittelyyn on lisättävä kaksi miljoonaa kiloa maata hehtaaria kohden. On vaikeaa hallita sairauksia muuttamalla maaperää. Aurakerros, jota pidetään yleensä 15 cm:n syvyyteen asti, tarkoittaa kahden miljoonan kilon maaperän käsittelyä hehtaaria kohden. Ei ole helppoa sekoittaa mitään tuotetta tasaisesti niin suureen maaperään.
Terveiden siementen käyttö ei takaa, että tytärmukulat ovat terveitä. Jopa terveiltä näyttävät siemenmukulat voivat kantaa S. scabies -itiöitä linssissä. Tämä selittää kuinka rupi voidaan tuoda peltoon, jossa ei ollut rupi.
Lajikekokeet, jotka on suoritettu pelloilla, joilla on voimakas rupitartunta, tarjoavat viljelijöille korvaamatonta tietoa. Uusia herkkiä lajikkeita, joilla on ostajien toivomia ominaisuuksia, tulee kasvattaa vain terveillä pelloilla. Robert Coffin mainitsi minulle, että pelloilla, joilla ei koskaan ollut perunaa, on raportoitu voimakasta rupitartuntaa. Siksi, jos vuokra-alueella on tuntematon yleisen rupitartuntojen taso, tartunta voidaan määrittää maaperän laboratorioanalyysillä. Ontariossa toimiva A&L Biologicals tekee tämä viljelijöille.
Monet Pohjois-Amerikan jalostusohjelmat ovat asettaneet rupien vastustuskyvyn etusijalle jalostustyössään. Ajan myötä tämä voi auttaa saavuttamaan tämän taudin hyväksyttävän hallinnan.